清查摸底的内容包括建档立卡户的户主姓名、户籍地址、建档立卡人口数、是否整户自然减少或失联、是否易地扶贫搬迁户、是否举家外出户、户主联系电话、其他联系电话、现居住区域、现居住地址、分组编码、备注等信息，共12个指标。